FOROS ISIS 1er Foro Internacional de Bioinformática:
Ciencia y Tecnología para el futuro del país
Silvia y Marcela
Jordan-Bogota-April2014
Eduardo Vela
Carlos Vasquez
Diego Riano UA_MBC_DMRP_2014
Marco Cristancho
Jorge Duitama
BIOS Official Spanish Apr2014 - UniAndes
Maria Mercedes
Alejandro Delgado
Fernando Barraza
e-Clouds A Platform and Marketplace to Access and Publish Scientific Applications as a Service - Foro Bioinformática - Mario Villamizar
Video Introductorio
Videos de Panelistas
Silvia Restrepo, decana de la Facultad de Ciencias de la Universidad de los Andes, interviene durante el 1er Foro Internacional de Bioinformática, organizado por el Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación de Uniandes.
Jorge Duitama, investigador en bioinformática del Centro Internacional de Agricultura Tropical, interviene durante el 1er Foro Internacional de Bioinformática, organizado por el Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación de Uniandes.
Mauricio Rodríguez, director general del Centro Colombiano de Bioinformática y Biología Computacional (BIOS), interviene durante el 1er Foro Internacional de Bioinformática, organizado por el Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación de Uniandes
Mario Villamizar, profesor del Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación de la Universidad de los Andes, interviene durante el 1er Foro Internacional de Bioinformática, organizado por Uniandes.
Marco Cristancho, investigador científico de Cenicafé, interviene durante el 1er Foro Internacional de Bioinformática, organizado por el Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación de Uniandes.
King Jordan, profesor asociado de Georgia Tech (Estados Unidos), interviene durante el 1er Foro Internacional de Bioinformática, organizado por el Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación de Uniandes.
Diego Riaño, representante del Laboratorio Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (CTBE), interviene durante el 1er Foro Internacional de Bioinformática, organizado por el Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación de Uniandes
Fernando Barraza, líder I+D de Parquesoft, interviene durante el 1er Foro Internacional de Bioinformática, organizado por el Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación de Uniandes.
Alonso Verdugo, client technical professional -- software industry solutions -- i2 portfolio de IBM, interviene durante el 1er Foro Internacional de Bioinformática, organizado por el Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación de Uniandes.
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Con la participanción de:
Media partner:
Objetivo
El mundo está de lleno en la nueva era de la Biología Computacional. Esta rama de la Biología y de las Ciencias Computacionales tiene un rol esencial en estudios a gran escala en temas que van desde la biodiversidad y la conservación hasta la solución de problemas en salud y agricultura que pueden significar la supervivencia humana en el mundo. Cada día se producen en el mundo millones de datos en el estudio de la Biología y la Medicina y gracias a los avances computacionales es ahora factible realizar análisis que hace unos años no habrían sido posibles.
La generación de estas cantidades masivas de datos es cada vez más económica y asequible. Sin embargo, el factor limitante ahora es el personal calificado y entrenado con la capacidad de analizar e interpretar los datos. Colombia debe posicionarse en esta área en la que tiene un alto potencial de ser competitiva. En este foro se discutirán tecnologías de punta en Biología Computacional, así como el rol que juegan para acelerar el desarrollo del país.
Fecha:
Jueves 10 de Abril 2014
Hora:
7:30 A.M. - 7:00 P.M.
Lugar:
Universidad de los Andes- Auditorio A y B del Edificio Mario Laserna. Cra. 1 Este No. 19 A - 40
| Hora | Evento |
| 7:00 a.m. - 8:00 a.m. | Registro |
| 8:00 a.m. - 9:00 a.m. | Introducción José Rafael Toro, Vicerrector Académico Uniandes Silvia Restrepo, Decana Facultad de Ciencias Uniandes Marcela Hernández, Profesora Ingeniería de Sistemas y Computación Uniandes |
| Track Visión Internacional | |
| 9:00 a.m. - 9:40 a.m. | Charla: Ancestry, Admixture and Selection in Colombian Genomes King Jordan, Georgia Tech |
| 9:40 a.m. - 10:10 a.m. | Charla: Nuevas Capacidades para un Nuevo País Carlos Vásquez, Microsoft |
| 10:10 a.m. - 10:40 a.m. | Charla: Global Technology Outlook 2014 Alonso Verdugo, IBM |
| 10:40 a.m. - 11:00 a.m. | Café |
| Track científico | |
| 11:00 a.m. - 11:20 a.m. | Charla: Estudios genómicos de especies relevantes en la cadena productiva del bioetanol en Brasil Diego Riaño, CTBE |
| 11:20 a.m. - 11:40 a.m. | Charla: Diferenciando el Café de Colombia a través de estudios de Genómica y Bioinformática Marco Cristancho, Cenicafé |
| 11:40 a.m. - 12:00 m | Charla: Genética de poblaciones y mejoramiento de cultivos utilizando tecnologías de secuenciación de alto rendimiento Jorge Duitama, CIAT |
| 12:00 m. - 2:00 p.m. | Almuerzo |
| Track Empresarial | |
| 2:00 p.m. - 2:20 p.m. | Charla: Hacia la bioeconomía basada en el conocimiento a través de la alta tecnología Mauricio Rodríguez, BIOS |
| 2:20 p.m. - 2:40 p.m. | Charla: Corpogen: adaptación en la era digital María Mercedes Zambrano, CORPOGEN |
| 2:40 p.m. - 3:00 p.m. | Charla: La transformación productiva a través de la bioinformática Alejandro Delgado, PTP |
| 3:00 p.m. - 3:20 p.m. | Charla: Servicios en la nube para proyectos en Bioinformática: consideraciones técnicas y de negocio Fernando Barraza, Parquesof |
| Track Técnico | |
| 3:20 p.m. - 3:45 p.m. | Charla: Cloud Científico Mario Villamizar, Uniandes |
| >3:45 p.m. - 4:10 p.m. | Café |
| Panel de Discusión | |
| 4:10 p.m. - 5:30 p.m. | "La bioinformática en Colombia" |
| 5:30 p.m. - 7:00 p.m. | Coctel y Sesión de Networking |
Panelistas
Alonso Verdugo
Actualmente, Alonso trabaja en IBM (Client Technical Professional – Software Industry Solutions – i2 Portfolio). La tecnología i2 permite a las agencias gubernamentales y empresas del sector privado investigar, predecir, prevenir y detener las amenazas criminales y terroristas más sofisticadas del mundo. Alonso enseña a los clientes cómo utilizar esta tecnología para su negocio (Seguridad del hogar y de los territorios, Policía, Finanzas, Retail, Seguros, Telecomunicaciones, Salud, etc) Sus certificaciones incluyen IBM SOA Design, COBIT e ITIL.
Carlos Vásquez
Carlos Vásquez, Ingeniero de Sistemas con 26 años de experiencia laboral e investigativa tanto en Colombia, Latinoamérica y EE.UU. Desde hace 18 años trabaja en Microsoft en diferentes posiciones tanto locales como Regionales. Nueve (9) años en la división de Servicios Empresariales de Consultoría y ha participado en el desarrollo de productos en la casa matriz de Microsoft en Seattle, EE.UU.
Actualmente se desempeña en Microsoft como Director Nacional de Tecnología (National Technology Officer (NTO)) para Colombia, quien actúa como vocero líder para la subsidiaria en todos los aspectos de estrategia tecnológica de la compañía a futuro y su relación con el desarrollo de políticas públicas para el uso de la tecnología en Gobierno, y Academia así como en proyectos sociales del país.
King Jordan
King Jordan es Profesor Asociado de la Escuela de Biología y Director del Programa de Postgrado en Bioinformática en el Instituto de Tecnología de Georgia. Obtuvo un doctorado en Genética de la Universidad de Georgia en 1998 y posteriormente se incorporó como investigador postdoctoral en el Departamento de Ciencias Biológicas de la Universidad de Nevada. Desde 2002 hasta 2006 estuvo trabajando en el Centro Nacional de Información sobre Biotecnología-NCBI en diferentes posiciones, y luego comenzó a trabajar en la tecnología de Georgia.
Sus principales intereses son el desarrollo y la aplicación de algoritmos para el análisis genómico funcional de alto rendimiento de datos de secuencia: montaje del genoma, ChiP-seq, RNA-seq y la creación de programas de la web habilitada para la epidemiología molecular y la genómica comparativa.
Diego Riaño
Entre 2010 y 2012 el Dr. Riaño-Pachón fue profesor Asistente en el Departamento de Ciencias Biológicas de la Universidad de Los Andes en Bogotá, donde lideró el grupo de investigación en Biología Computacional y Evolutiva, integrado por estudiantes de pregrado y postgrado. Desde Febrero de 2013, dirige un grupo de investigación en el Laboratorio Nacional de Ciencia y Tecnología del Bioetanol (CTBE), parte del Centro Nacional de Investigación en Energía y Materiales (CNPEM), en Campinas, São Paulo, Brasil (http://bce.bioetanol.cnpem.br/)
Marco Cristancho
Microbiólogo de la Universidad de los Andes, con PhD en Biología Molecular de Plantas de la Universidad de Manchester y Postdoctorado en Bioinformática de Cornell University. Actualmente, es Investigador de Cenicafé, lidera proyectos para la caracterización y el control de la roya del café, es miembro del equipo de trabajo de la disciplina de Fitopatología, y líder del grupo de Bioinformática del Centro.
Jorge Duitama
Ingeniero y Magister en ingeniería de sistemas de la Universidad de los Andes. Ph.D. en ciencias de computación de la Universidad de Connecticut. Trabajó en el Instituto Max Planck de genética molecular como asistente de investigación y en la Universidad Católica de Lovaina como postdoc. Actualmente trabaja como investigador en bioinformática en el CIAT en donde investiga el uso de las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento como herramienta para el desarrollo de variedades mejoradas de arroz, yuca, frijol y pastos.
Mauricio Rodriguez
El Dr. Mauricio Rodríguez es actualmente Director General del Centro de Bioinformática y Biología Computacional de Colombia, también conocida como BIOS. Anteriormente se desempeñó como Gerente del Programa Nacional de Biotecnología, en el Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación – COLCIENCIAS.
María Mercedes Zambrano
Bióloga de Wellesley College (EEUU) y PhD en Microbiología y Genética Molecular de la Universidad de Harvard (EEUU). Fundamos la Corporación Corpogen con la Dra. Patricia Del Portillo en 1995, donde he trabajado desde entonces. En el momento soy Directora Científica, superviso varias tesis y lidero proyectos de investigación en las áreas de la Ecología microbiana, metagenómica y patogénesis bacteriana. En el momento también lidero el Centro de Genómica y Ambientes Extremos Gebix, una red de trabajo en metagenómica y bioprospección.
Alejandro Delgado
Gerente del sector de software y Ti del programa de transformación productiva del Ministerio de comercio, industria y turismo. Administrador de empresas de la Universidad de Louisiana y MBA de la misma universidad, especialista de Geopolítica de la universidad EAFIT, maestría de análisis de problemas económicos y políticos internacionales de la academia diplomática colombiana.
Fernando Barraza
Profesor Asociado, Coordinador Maestría en Ingeniería de Software Universidad de San Buenaventura Cali.
Mario Villamizar
Experto temático en proyectos de Cloud Computing y docente de la Universidad de los Andes donde participa, investiga y lidera proyectos a nivel nacional e internacional relacionados con modelos de negocio en Cloud Computing, gestión y adopción de tecnologías Cloud a nivel empresarial, diseño de infraestructura de TI escalables y automatizadas, desarrollo ágil de aplicaciones web/móviles para plataformas Cloud e implementación de soluciones de Software como servicio.
Flujos de Trabajo de Bioinformatica en la Nube
Análisis de secuencias al alcance de todos
¿A quién está dirigido?
Este taller teórico-práctico está dirigido a investigadores en ciencias biológicas, ciencias de la computación y áreas afines que estén interesados en el análisis de secuencias (que no requieren uso de la línea de comandos), las cuales explotan el poder computacional disponible en la nube, con servidores gratuitos o que pueden ser alquilados de acuerdo a las necesidades de los grupos de investigación.
¿Qué temáticas se tratarán?
El taller inicia con una introducción al proyecto Galaxy, el cual, mediante una interfaz web, permite no solo llevar análisis individuales de datos biológicos, sino también inter-conectarlos para formar flujos de trabajo complejos, en una forma dinámica y amigable con el usuario.
La segunda parte del taller, dará una introducción a la computación en la nube, familiarizando al participante con las diferentes opciones y herramientas disponibles. En particular, se mostrará una aproximación práctica al uso del BLAST en la nube resaltando las ventajas y desventajas de esta aproximación.
Costo
Estudiantes*:$ 100.000
Externos:$ 250.000
*Los estudiantes deben presentar carnet vigente para ingresar al taller
Lugar
Salas Waira (Laboratorios ML 612 y 613)
Edificio Mario Laserna, Universidad de los Andes
Cra 1Este No. 19 A – 40
Fechay hora
Fecha: 9 de abril
Hora: 5:00 p.m. a 9:00 p.m.
contacto
María Isabel Rodriguez
mi.rodriguez21-at-uniandes.edu.co
Dictado por
Diego Riaño
- Postdoctorado en Bioinformática del Instituto Max Plank de Fisiología Molecular Vegetal, Universidad de Potsdam, Alemania
- Ph.D.en Biología Molecular Vegetal, Universidad de Potsdam, Alemania
- Biólogo, Universidad Nacional de Colombia
Entre 2010 y 2012 el Dr. Riaño-Pachón fue profesor Asistente en el Departamento de Ciencias Biológicas de la Universidad de Los Andes en Bogotá, donde lideró el grupo de investigación en Biología Computacional y Evolutiva, integrado por estudiantes de pregrado y postgrado. Desde Febrero de 2013, dirige un grupo de investigación en el Laboratorio Nacional de Ciencia y Tecnología del Bioetanol (CTBE), parte del Centro Nacional de Investigación en Energía y Materiales (CNPEM), en Campinas, São Paulo, Brasil (http://bce.bioetanol.cnpem.br/).
Ha publicado más de 20 artículos de investigación, que han recibido más de 1900 citaciones en total. Sus principales líneas de actuación incluyen el desarrollo de bases de datos para la integración de datos provenientes de tecnologías ómicas, los métodos de clasificación y aprendizaje de máquina aplicados a problemas biológicos, el estudio de la regulación de la transcripción en eucariotes, la evolución de las redes de regulación génica, y el ensamblaje y anotación de genomas de diversos procariotes y eucariotes. Entre sus intereses también está el desarrollo de flujos de trabajo y el despliegue de herramientas que faciliten el uso de infraestructura computacional de alto rendimiento.
Mario Villamizar
- Master en Ingeniería de Sistemas y Computación, Universidad de los Andes
- Ingeniero de Sistemas, Universidad Francisco de Paula Santandar
Experto temático en proyectos de Cloud Computing y docente de la Universidad de los Andes donde participa, investiga y lidera proyectos a nivel nacional e internacional relacionados con modelos de negocio en Cloud Computing, gestión y adopción de tecnologías Cloud a nivel empresarial, diseño de infraestructura de TI escalables y automatizadas, desarrollo ágil de aplicaciones web/móviles para plataformas Cloud e implementación de soluciones de Software como servicio.
Mario ha sido autor de más de 30 publicaciones internacionales en temas relacionados con computación de alto rendimiento, Grid y Cloud Computing. Sus áreas de interés actuales son Cloud Computing arquitecturas de aplicaciones escalables y proyectos de emprendimiento en internet.
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