Maestrias
Actualmente, el Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación ofrece 9 programas de maestrías.
Programas de maestría
Modalidad presencial
MATI
Maestría en Arquitecturas
de Tecnologías de Información 
SNIES: 101531
MESI
Maestría en
Seguridad de la Información 
SNIES: 102074
MBIT
Maestría en Tecnologías
de Información para el Negocio 
SNIES: 102269
MISIS
Maestría en
Ingeniería de Sistemas y Computación 
SNIES: 1579
MINE
Maestría en
Ingeniería de Información 
SNIES: 104986
Maestría en conjunto con el Departamento de Ciencias Biológicas
MBC
Maestría en
Biología Computacional 
SNIES: 102711
Modalidad virtual
MISO
Maestría en
Ingeniería de Software 
SNIES: 102073
MAIA
Maestría en
Inteligencia Artificial
SNIES: 116021
MAIT
Maestría en
Gerencia de Tecnologías de Información
SNIES: 116350
Adicionalmente, anualmente la Escuela de Posgrados ofrece cursos en el periodo intersemestral los cuales junto con los demás cursos de la Escuela de Verano Internacional de la Facultad permiten a los estudiantes conocer las últimas tendencias y avances de la Ingeniería.
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