La organización general y la coordinación del evento se realizan desde Uniandes, con apoyo de ACIS (Asociación Colombiana de Sistemas) y ACM-ICPC (International College Programming Contest). En Uniandes hay un equipo técnico apoyado en la DTI y en el Datacenter del DISC, liderado por el Profesor Mario Sánchez, para poder realizar la competencia en la sede de Bogotá y, así mismo, coordinar las actividades correspondientes en las demás sedes. Para la Maratón Nacional hay inscritos 5 equipos Uniandinos. Estos han sido entrenados por el Profesor Mario Sánchez, pero en la competencia tendrán como coach oficial a la Profesora Sandra Rueda.
La Maratón Nacional, además de ser una competencia importante en sí misma, puesto que reúne alrededor de 100 equipos de programadores de universidades todo el país, sirve de clasificatoria para la Maratón Regional Latinoamaericana 2012 que tendrá lugar el próximo 10 de Noviembre, en la que los mejores de Colombia se medirán con sus pares de toda Latinoamérica para clasificar a la Final Mundial (en 2013, en San Petersburgo, Rusia).
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